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2022年2月1日火曜日

掲載論文解説:トマトにおける光受容体フィトクロム変異体は暑さに強い表現型を示す

 日本語解説

Abdellatif et al. (2022) Int J Mol Sci 23, 1681

ポイント

1.トマト光受容体フィトクロム変異体phyA, phyB1B2では、栄養成長期において、暑さに強い表現型を示す。

2.通常トマトの花粉は暑くなると稔性が下がるが、変異体では野生型よりも稔性が高い。ただ、着果はそれほど変わっていなかった。

3.栄養成長期において耐暑性が付与されることから、今後のゲノム編集のターゲットとしての利用も期待できる。


論文内容

温暖化の影響もあり、熱ストレスが世界的な問題となってきている。特に農業という視点から、熱ストレスは植物の成長を阻害するとともに、収量の減少を引き起こす。本研究では、トマトフィトクロム変異体phyA, phyB1B2が栄養成長期に高温耐性を示すことを明らかにした。夏場のガラス温室は、気温が50℃以上に達することも少なくない状況ですが、そのようなガラス温室内では通常のトマトは萎れたり、弱ってきたりしますが、phyA, phyB1B2変異体は下図のように良好な生育をみせました。これは、高温時における膜の安定性と水分保持が強化されたためと考えられます。


一方で、生殖成長期において、高温時における花粉の稔性が変異体で上がってはいたものの、着果率に関しては、野生型と大きな違いは見られなかった。

これらのことから、phyA, phyB1B2変異体は栄養成長期に高温耐性を示すことが明らかとなった。夏場をこの変異体で乗り切って、秋で実をつけさせるということを行えば、この変異体が有効利用できるのではないかと思われる。もともと変異体なので、ゲノム編集などで変異を導入するといった使い方もあると考えられる。

2021年2月28日日曜日

今年度ももうすぐ終わりです

 早いもので、今年度も、あと1か月となってしまいました。今年度は前半がコロナでほとんどストップした状況なので、後ろの方にしわ寄せがきて忙しないです。

この2月は論文が2つアクセプトになり、良かったです。いずれも「つくばシステム」を用いた成果なのですが、1つはつくばシステムによる一過的発現によりゲノム編集トマトを作出するというものをPlant Cell Reportsに掲載しました。

もう一つは、一過的発現をする際、発現させるタンパク質によっては壊死が起きるのですが、それを抑制する方法です。100mM以上(200mMが経験上効きが良い)という高濃度アスコルビン酸を噴霧するという単純な方法で壊死が抑制できたというものでPlant Physiologyに拾ってもらいました。壊死については総説とかみても、小胞体ストレスが原因だろうとか書いてあるのですが、原因は分かったからどうやったら防げるのか調べても、全くみつかりませんでした。そこが知りたいのに書いていないということは、明らかにされていないことなので、いくつか試すことにした、というのがきっかけです。作りたいタンパク質が壊死によって作れなかったので。この壊死を何とかしたいと思い、常法通り、数mMアスコルビン酸を噴霧しても全く改善されず仕舞いでした。まあ、普通に考えると、ここでおしまいで、他の方法を試すべきなのでしょうが、アスコルビン酸なんて安いものだから、10倍(30mM)、100倍(300mM)を噴霧してしまえと試しました。このような高濃度の液体を植物に与えるということは常識的にはしないのでしょうが、時には常識の範囲外ということも試してみないといけないということでしょう。

2020年9月11日金曜日

Frontiers in Plant Scienceに掲載されました

東北大学の加藤幸成先生と共同研究で行っていた論文がFrontiers in Plant Scienceに掲載されました。加藤先生が開発されたRAPタグ(DMVNPGLEDRIE)が植物においても有効であることで、植物における小型タグのレパートリーを増やすことができました。また、RAPタグ抗体も加藤先生のところで開発されていたのですが、RAPタグ抗体を植物にて作製することに成功しました。そこそこの量がとれるし、何よりもProtein Gカラムで純度が高く精製できるという利点があります。植物なので、抗体がないというのが強みです。CHO細胞に比べると低コストで作製できることから、低コストで抗体が必要な場面(診断抗体とか)での抗体作製に有効活用できるものと考えております。

2020年1月16日木曜日

Communications Biologyに掲載

結構、前々から行っていた研究なのですが、最後の最後で詰まっていた論文を、Communications Biologyに掲載することに至りました。
プレスリリースはこちら

植物型SUMO E3 ligaseしかPHDフィンガーをもたないのですが、このPHDフィンガーがヒストン修飾(H3K4me3)を認識したり、メチル化酵素を認識したりして、発現調節に関わっていることを明らかにしました。

何とか掲載まで至ってほっとしているところです。
Communications BiologyはSpringer Natureが出した新しい雑誌なので、今年にインパクトファクターがつく予定です。いくつになるか楽しみです。折角なので、ドンと高いと良いですが。

そういえば、Nature Foodという雑誌も創刊されましたね。トマトの成果とかをこういった雑誌に載せられれば良いですが。

2018年8月9日木曜日

論文が掲載されました。

Scientific Reports誌へ三浦謙治教授・寿崎拓哉准教授らの論文が掲載
【植物における低温シグナル伝達経路に関与する新たな因子を同定】
植物における低温ストレス応答において、抑制的にはたらく転写因子の役割を明らかにしました。

https://gene.t-pirc.tsukuba.ac.jp/archives/2030.html
https://www.nature.com/articles/s41598-018-29722-x

ICE1との2ハイブリッドスクリーニングによって単離した因子ですが、ようやく論文掲載までこぎつけました。

Researcher IDのぞいたらH-indexが28までいきました。
http://www.researcherid.com/rid/C-2803-2011
目指せ30ですかね。

2018年3月20日火曜日

論文が掲載されました。

今年度は後半にかけて結構頑張って論文を出しています。

Scientific Reports誌へ三浦謙治教授・江面浩教授・星川健助教らの論文が掲載
【植物でタンパク質を大量に作る技術を開発 ~一過的発現システムの改良~】
植物において、タンパク質発現システムのスタンダードとなり得るベクターの構築に成功した重要な成果であり、特許協力条約(PCT)に基づく特許出願済みです。

詳細はこちらをご覧ください。
植物で大量にタンパク質を作れるようになりました。大腸菌や酵母の発現系に匹敵するレベルのタンパク質生産ができました。これを使えば色々なタンパク質の生産が可能になります。大腸菌等で発現しにくいタンパク質を作製するための新たなシステムとなると考えております。こちらに関してはPCT出願まで至りました。

あと、総説ですが、Plant Physiology & Biochemistryに掲載されました。
こちらはナス科ゲノム編集に関わる動向をまとめたものです。

結構書き物をしました。




2018年2月21日水曜日

論文が掲載されました

壽崎先生(おめでとうございます!)と共同研究していた内容がNat. Comm.に掲載されました。
https://www.nature.com/articles/s41467-018-02831-x
植物-微生物共生も奥が深くて興味深いですね。

あと久々にResearcher IDのぞいたらH-indexが27に上がっていました。
http://www.researcherid.com/rid/C-2803-2011
今後も注目されるような研究を続けていきたいと思います。

2018年1月15日月曜日

論文掲載されました

東京学芸大の飯田先生と一緒に行っていた仕事がScientific Reportsに掲載されました。
https://www.gene.tsukuba.ac.jp/research/
https://www.tsukuba.ac.jp/attention-research/p201801111901.html

Scientific Reports誌へ三浦謙治教授・壽崎拓哉准教授、飯田秀利教授(東京学芸大)らの論文が掲載
【植物低温ストレス応答に関与する新たな仕組みを解明】
植物のカルシウムチャネルMCAが低温ストレス応答に重要であることを明らかにしました。

https://www.nature.com/articles/s41598-017-17483-y

Ca2+-permeable mechanosensitive channels MCA1 and MCA2 mediate cold-induced cytosolic Ca2+increase and cold tolerance in Arabidopsis


何とか掲載されました。ホッとしています。
詳しい内容はリンク先のプレス文章をご覧下さい。


2016年10月20日木曜日

論文掲載

ちょっと前になりますが、Purdueの時の同僚で中国科学院にいるJing Bo Jin教授と長年一緒に研究を行っていた仕事がPLoS Geneticsに掲載されました。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27128446

An Arabidopsis SUMO E3 Ligase, SIZ1, Negatively Regulates Photomorphogenesis by Promoting COP1 Activity.


COP1と呼ばれる光形態形成に関わる因子ですが、このCOP1が翻訳後修飾因子SUMO化のターゲットであり、SUMO化されることで光形態形成に負に働くという内容です。



もう1件、かなり前にグリーンイノベーションとして京大時代のボスが京大退官後、石川県大で行っていたEuphorbia tirucalliを研究材料にしたことがありました。それ以来、ほとんど手をつけず仕舞でしたが、京都工芸繊維大学の北島先生が精力的に進められ、論文化することができました。

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27566924

Transcriptome and proteome analyses provide insight into laticifer's defense of Euphorbia tirucalli against pests.


Euphorbia tirucalliの乳液のEST、RNA-seq、タンパク質同定を行い、情報を揃えたという感じです。ここから有益な遺伝子が使われるようになると良いですね。




2014年4月9日水曜日

Short communication

Plant Signaling Behaviorという雑誌に投稿させて頂きました。
岡山大学の村田先生との共同研究です。
サリチル酸によって気候開閉や乾燥ストレスに影響があるという内容です。

https://www.landesbioscience.com/journals/psb/article/28085/

久々の論文掲載と相成りました。
ご協力頂いた皆様、感謝申し上げます。

2014年1月16日木曜日

Review article

Frontiers in Plant Scienceで魚住先生及び刑部博士がEditorとして
"Water stress responses in plants"
のタイトルでResearch topicが掲載されました。

そのResearch topicへの貢献としてreview articleを香川大の多田先生と一緒に執筆させて頂きました。
"Regulation of water, salinity, and cold stress responses by salicylic acid"
環境ストレス応答へのサリチル酸の関わりを中心にreviewとしてまとめました。
サリチル酸は病原菌への防御として用いられることは良く知られており、サリチル酸の生合成やレセプターに関する知見は多田先生にお任せしました。私はもっぱら環境ストレス応答への役割を執筆しました。こういったことはあまりまとめられていないので、それなりに良いreviewになったのではないかと思います。

2013年11月19日火曜日

Plant and Microbe Adaptations to Cold in a Changing World

上記タイトルでSpringerから本が出ました。
http://www.springer.com/life+sciences/plant+sciences/book/978-1-4614-8252-9?detailsPage=chapter

Proceeding的な感じで昨年行われた国際学会の演者が協力して仕上げた感じです。私も多少なりとも貢献しました。
ICE1, a Transcription Factor Involved in Cold Signaling and Tolerance

 最近、総説ばかりが多い(実は今も総説を仕上げています)ので原著を何とかせねば。

2013年10月2日水曜日

NBT

最近、新しい植物育種技術としてNBT(new plant breeding techniques)が色々と話題になってきています。最初は私も漠然としか知らなかったのですが、筑波大学の先生を中心に技術に関する解説本を出版する運びとなりました。

http://www.bunken.co.jp/item/2174/

国際文献社から発売しています。NBTも単にTALENとかだけでなく、今のところ8種類に分類分けされていて、それぞれに特徴があります。この本の取りまとめ及び国際文献とのやりとりを任されましたので、内容すべてに3回ぐらい目を通しましたが、技術解説本としてはなかなかの出来になったのではないかと思われます。学生さんにも買いやすいようにと、何とか1000円でお願いしました。来年4月から1080円になる?ので1050円のうちに是非。

驚きなのは、シロイヌナズナ扱っている人は、実はこのNBT手法を使っているのですね。

2011年11月9日水曜日

Book chapter

Springerから発刊される
"Abiotic Stress Response in Plants"
http://www.springer.com/life+sciences/plant+sciences/book/978-1-4614-0633-4
のChapter 13を執筆しました。

Chapter 13. Abiotic Stress and Role of Salicylic Acid in Plants
Miyuki Hara, Jun Furukawa, Aiko Sato, Tsuyoshi Mizoguchi, Kenji Miura
各々方、執筆のご協力ありがとうございます。
良かったら読んでみてください。

2011年7月8日金曜日

Plantaへの掲載

結構やっつけ仕事で出した論文ですが、無事Plantaに掲載されることになりました。

Title:
Increased tolerance to salt stress in the phosphate-accumulating Arabidopsis mutants siz1 and pho2
Miura K, Sato A, Ohta M, Furukawa J

IF2010を見ましたが、Plantaでなくて、Mol Plantに出しても良かったかとも思う今日この頃です。
2.5から4.2に急上昇です。さすが中国パワーという気もしないでもないですが。
研究の推進にご尽力頂き、誠にありがとうございました。
あと、研究を手伝って下さった学生バイトの方々にも感謝いたします。

2011年3月29日火曜日

Plant Journalへ掲載決定

2月頭にresubmissionをしていたのですが、アクセプトの通知が来ました。いやぁ、良かったです。
研究及び論文作成に当たり御助力頂きました諸先生、学生さんに感謝いたします。

今、研究トピックスを作成中なので、出来上がったらホームページにでも掲載しようかと思います。